Острые респираторные инфекции
Респираторные вирусы могут вызывать тяжелые заболевания с острой дыхательной недостаточностью, которая может прогрессировать до острого респираторного дистресс-синдрома.
До появления коронавирусной инфекции в конце 2019 года (COVID-19) яркими примерами тяжелых вирусных респираторных заболеваний были грипп А и В, тяжелый острый респираторный синдром (SARS) и метапневмовирус. В последние годы роль респираторных вирусов становилась все более доминирующей, но это стало еще более очевидным с появлением тяжелого острого респираторного синдрома, вызванного вирусом SARS-CoV-2.
Учитывая многочисленные случаи тяжелой вирусной дыхательной недостаточности, возникшей во время пандемии COVID-19, произошел сдвиг в парадигме относительно того, как мы рассматриваем вирусные респираторные заболевания.
Например, внедрение ПЦР-тестов в клинических условиях подтвердило, насколько важна их роль в диагностике вирусных респираторных инфекций, особенно в тяжелых случаях.
Оптимальная диагностика может способствовать рациональному лечению и дальнейшему предотвращению передачи вируса воздушно-капельным путем.
Дети и респираторные вирусы
Респираторные заболевания, вызываемые вирусами, являются одной из наиболее важных причин смертности и госпитализации во всем мире среди детей раннего возраста.
В настоящее время известно около 200 вирусных респираторных агентов, и следующие вирусы признаны ведущей причиной респираторных заболеваний у детей: респираторно-синцитиальный вирус (RSV), риновирус человека (HRV), вирус гриппа, вирус парагриппа (PIV) и аденовирус (AdV). Респираторные инфекции проявляются широким спектром клинических симптомов и признаков с различной степенью выраженности. Важный вопрос, касающийся этих инфекций, связан с факторами, которые потенциально могут привести к тяжелым последствиям и потребовать госпитализации.
Результаты исследований показывают [1], что дети, которые были госпитализированы из-за респираторного дистресс-синдрома, имели четко определенные характеристики: ранний возраст, RSV в качестве возбудителя, бронхиолит и наличие сопутствующей патологии.
Основные ключи:
1. Идентификация вируса является полезным маркером для оценки клинического течения ОРВИ у групп риска и необходимости госпитализации (например, выявление RVS для детей раннего возраста, вируса гриппа для пожилых, SARS-CoV-2 для пациентов с сахарным диабетом и др.).
2. Точная микробиологическая диагностика респираторных вирусов может помочь избежать ненужного лечения антибиотиками и назначить специфическое противовирусное лечение при наличии показаний.
3. Респираторные вирусы также участвуют в обострении хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ). В нескольких исследованиях сообщалось, что 50% обострений ХОБЛ вызваны респираторными вирусами [2].
4. При пневмонии респираторные вирусы составляют 10–20% случаев внебольничной пневмонии (ВП) у взрослых с установленным микробиологическим диагнозом [3]. Респираторные вирусы выявляются в 15–45% тяжелых случаев ВП.
NB! Что касается внутрибольничной пневмонии, респираторные вирусы составляют 10–30% случаев у взрослых [4].
5. Важно отметить, что у лиц с ослабленным иммунитетом возбудителями, часто ответственными за ОРВИ, являются и другие вирусы, такие как цитомегаловирус, вирус простого герпеса или вирус ветряной оспы.
6. Для выявления респираторных вирусов в случаях инфекций нижних дыхательных путей рекомендуются образцы мокроты, эндотрахеальный аспират и бронхоальвеолярный лаваж.
В более легких случаях мазки из носоглотки или смешанные соскобы являются оптимальными образцами для выявления респираторных вирусов из-за более высокой репликации вируса в верхних дыхательных путях.
NB! Репликация вируса в нижних дыхательных путях может обнаруживаться в течение более длительных периодов времени, чем в верхних дыхательных путях, а мазки из носоглотки в таких случаях могут давать ложноотрицательные результаты.
Литература:
1. Costa LF, Da Silveira HL, Queiróz DAO, Mantese OC, Yokosawa J. Respiratory virus infections in hospitalized and non-hospitalized children: determinants of severe course of the disease. J Infect Dev Ctries. 2022 Jan 31;16(1):196-205. doi: 10.3855/jidc.15117. PMID: 35192538.
2. Jang JG, Ahn JH, Jin HJ. Incidence and Prognostic Factors of Respiratory Viral Infections in Severe Acute Exacerbation of Chronic Obstructive Pulmonary Disease. Int J Chron Obstruct Pulmon Dis. 2021 May 7;16:1265-1273. doi: 10.2147/COPD.S306916. PMID: 33994783; PMCID: PMC8112874.
3. Cillóniz C, Ewig S, Polverino E, Marcos MA, Esquinas C, Gabarrús A, Mensa J, Torres A. Microbial aetiology of community-acquired pneumonia and its relation to severity. Thorax. 2011 Apr;66(4):340-6. doi: 10.1136/thx.2010.143982. Epub 2011 Jan 21. PMID: 21257985.
4. Vanhems P, Bénet T, Munier-Marion E. Nosocomial influenza: encouraging insights and future challenges. Curr Opin Infect Dis. 2016 Aug;29(4):366-72. doi: 10.1097/QCO.0000000000000287. PMID: 27362641.
Определение ДНК Streptococcus pneumoniae методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Соскоб эпителия зева | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскоб эпителия носа | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Бронхоальвеолярный лаваж | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.36
Срок выполнения: 2 суток
Определение ДНК Haemophilus influenzae методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Соскоб эпителия зева | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскоб эпителия носа | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Бронхоальвеолярный лаваж | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.37
Срок выполнения: 2 суток
Определение ДНК Legionella pneumophila методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Соскоб эпителия зева | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскоб эпителия носа | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Бронхоальвеолярный лаваж | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.38
Срок выполнения: 2 суток
Определение ДНК Chlamydophila pneumoniae методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Соскоб эпителия зева | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Бронхоальвеолярный лаваж | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.39
Срок выполнения: 2 суток
Определение ДНК Mycoplasma pneumoniae методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Соскоб эпителия зева | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Бронхоальвеолярный лаваж | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.40
Срок выполнения: 2 суток
Определение ДНК Bordetella pertussis/parapertussis/bronchiseptica методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Соскоб эпителия с задней стенки глотки | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскоб эпителия носа | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Смешанный соскоб эпителия с задней стенки глотки и носа | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.41
Срок выполнения: 2 суток
Определение возбудителей ОРВИ человека (коронавирус SARS-CoV-2, вирусы гриппа А и В, респираторно-синцитиальный вирус, вирусы парагриппа 1-4 типов, риновирус, аденовирус, метапневмовирус, коронавирусы HKU1, NL63, OC43, 229E, бокавирус) методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Мазок из носоглотки | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мазок из ротоглотки | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Эндотрахеальный/назофарингеальный спират | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Бронхоальвеолярный лаваж | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.42.2
Срок выполнения: 2 суток
Определение РНК коронавируса SARS-CoV-2 методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Мазок из носоглотки | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мазок из ротоглотки | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Бронхоальвеолярный лаваж | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
Код услуги: П3.45.1
Срок выполнения: 1 сутки
Определение ДНК условно-патогенных бактерий, вызывающих нозокомиальные и внебольничные инфекции методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Цельная кровь | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Моча | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Кал | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Аспираты/экссудаты | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскобы эпителия с дыхательных путей (зев/нос) | Зев подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Нос подготовка к исследованию | взятие биоматериала | |
| Соскобы эпителия с ЖКТ и УГТ | Соскоб эпителия прямой кишки подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскоб цервикального канала | |
| Соскоб влагалища | |
| Соскоб уретры | |
| Бактериальные культуры |
Код услуги: М23.40.6.2
Срок выполнения: 1 сутки
Определение генов резистентности к гликопептидным и бета-лактамным антибиотикам методом амплификации НК с флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени"
Вид биоматериала:
| Цельная кровь | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Моча | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Мокрота | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Кал | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Аспираты/экссудаты | подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскобы эпителия с дыхательных путей (зев/нос) | Зев подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Нос подготовка к исследованию | взятие биоматериала | |
| Соскобы эпителия с ЖКТ и УГТ | Соскоб эпителия прямой кишки подготовка к исследованию | взятие биоматериала |
| Соскоб цервикального канала | |
| Соскоб влагалища | |
| Соскоб уретры | |
| Бактериальные культуры |
Код услуги: П9.1
Срок выполнения: 1 сутки